- Las bases de la Escuela Militar de Clases de Sanidad se remontan al año de 1960, siendo Presidente de la República Mexicana el Ciudadano Adolfo López Mateos, mediante su mandato fue creado el primer Curso de Auxiliares de Enfermería con dos meses de duración y en 1966 se iniciaron los Cursos de Higiene y Saneamiento con duración de tres meses.
- En 1968 se crea en la Dirección General de Sanidad, el Centro de Capacitación de tropas de Sanidad.
- El 26 de junio de 1973, fue denominada Escuela Militar de Tropas de Sanidad, ubicada en las instalaciones del Hospital Central Militar.
- El 28 de julio de 1976 pasó revista de entrada como Escuela Militar de Clases de Sanidad, en las instalaciones de la Escuela Militar de Oficiales de Sanidad, hasta el año 1984.
- El 16 de febrero de 1986, entra en receso como plantel cambiando su denominación a Cursos de Formación de Clases de Sanidad, dependiendo técnicamente de la Dirección General de Educación Militar y Rectoría de la U.D.E.F.A., y administrativamente de la Dirección General de Sanidad, teniendo su sede en dicha dirección
- Con fecha 16 de diciembre de 1998, pasa nuevamente revista de entrada como Escuela Militar de Clases de Sanidad, estableciendo su matriz en la Dirección General de Sanidad.
- La Escuela Militar de Clases de Sanidad, en el periodo comprendido del 2000 al 2013 se ubicó en la Escuela Militar de Odontología, posteriormente en el periodo comprendido del 2013-2014 se ubicó en la Escuela Militar de Enfermeras.
- El 15 de marzo del 2014, se inició el proyecto de construcción del “Centro Militar de Ciencias de la Salud”.
- El 6 de febrero del 2015, se concluyó la construcción de la primera fase del “Centro Militar de Ciencias de La Salud”, por lo que la Escuela Militar de Clases de Sanidad, ocupa sus instalaciones actuales.