La emisión de permisos forma parte del control sanitario de estupefacientes, psicotrópicos y sustancias químicas y pueden dividirse en dos grupos:
En materia de comercio internacional:
- Permiso Sanitario de Importación de Materias Primas o Medicamentos que sean o contengan Estupefacientes o Psicotrópicos.
- Modificación al Permiso Sanitario Previo de Importación de Materias Primas o Medicamentos que Sean o Contengan Estupefacientes o Psicotrópicos.
- Permiso de Exportación de Materias Primas o Medicamentos que sean o contengan Estupefacientes o Psicotrópicos.
En materia de control interno:
- Permiso de Libros de Control de Estupefacientes o Psicotrópicos.
- Permiso para utilizar Recetas Especiales con código de Barras para prescribir Estupefacientes (Primera Vez y Subsecuente).
- Permiso de Adquisición en Plaza de Materias Primas o Medicamentos que sean o contengan Estupefacientes o Psicotrópicos.