Cuenta con 39 unidades distribuidas en el territorio nacional, agrupadas en cinco coordinaciones regionales, acordes a las regiones de la Secretaría de Agricultura: Noroeste, Noreste, Centro Occidente, Centro y Sur Sureste. Cada unidad cuenta con el personal técnico capacitado y la infraestructura necesaria para dar atención a los productores de semillas. La implementación de los programas de calificación de semillas, las verificaciones de comercios y de variedades vegetales, así como la aplicación del marco normativo, es ejecutado por las Unidades.
