Este Parque alberga importantes reservas forestales que incluye ecosistemas de chaparral, bosque de pino piñonero y bosque mixto de coníferas.
Es hogar del puma (Puma concolor), gato montés (Lynx rufus), borrego cimarrón (Ovis canadensis cremnobates), coyote (Canis latrans), tejón (Taxidea taxus) y zorro (Urocyon cinereoargenteus), algunas en categoría de riesgo según la NOM-059-SEMARNAT-2010.
Actualmente, la Comisión Nacional de Áreas Naturales Protegidas lleva a cabo en el Parque, el Programa de reintroducción del cóndor de California (Gymnogyps californianus), especie considerada extinta hasta 2010, año en el que este estatus cambió a la categoría ¨peligro de extinción¨, gracias a su reintroducción gradual.
Este programa ha reintroducido con éxito ejemplares criados en cautiverio en Baja California, California y Arizona. De acuerdo con cifras de la CONANP, existe una población de 39 cóndores dentro del Parque, de los cuales 33 nacieron en cautiverio y seis en vida libre.
