A cargo de la Subsecretaría de Población, Migración y Asuntos Religiosos se encuentran las Unidades Administrativas encargadas de desarrollar políticas integrales de población y migración, que contribuyan a la inclusión, la prosperidad y el ejercicio de derechos.

Las Unidades adscritas al Subsecretario de Gobierno son: 
  • Unidad de Política Migratoria   
  • Dirección General del Registro Nacional de Población e Identificación Personal      
  • Dirección General de Asociaciones Religiosas
Por sus atribuciones los siguientes órganos desconcentrados están adscritos a esta Subsecretaría: 
  • Instituto Nacional de Migración
  • Secretaría General del Consejo Nacional de Población
  • Coordinación General de la Comisión Mexicana de Ayuda a Refugiados