- Comité de Bioseguridad
- Comité de Ética en Investigación
- Comité de Investigación
- Comité de Control de Infecciones
- Comité de Vigilancia Epidemiológica
- Comisión Central Mixta de Capacitación
- Comité Hospitalario de Bioética
- Comité de Ética y de Prevención de conflictos de interés del INER
- Comité de Becas
- Comité de Adquisiciones, Arrendamientos y Servicios
- Comité de Apoyo y Seguimiento de los Recursos Destinados a la Investigación
- Comité de Bienes Muebles
- Comité de Costos
- Comité de Evaluación de Ingresos
- Comité de Evaluación del Expediente Clínico
- Comité de Morbi-Mortalidad
- Comité de Obras Públicas y Servicios relacionados con las mismas
- Comité Hospitalario de emergencias, desastres y protección civil
- Comité de Trasplante Pulmonar
- Comité de Calidad y Seguridad del Paciente del INER
- Comité de Farmacia y Terapéutica
- Comité de Garantía de Calidad del Equipamiento Médico de Rayos X
- Comité Interno de Medicina Transfusional
- Comité de Transparencia