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El Centro de Monitoreo de Puentes y Estructuras Inteligentes (CMPEI) tiene como objetivo la evaluación estructural de los puentes mexicanos instrumentados por la Secretaría de Comunicaciones y Transportes (SCT); para satisfacer el objetivo es necesario analizar, en tiempo real, la información de los sensores instalados en conjunto con la aplicación de metodologías para la detección oportuna de daño y la generación de esquemas de actuación. Esta investigación tiene como finalidad establecer una metodología para generar protocolos de actuación a corto, mediano y largo plazo en los puentes monitoreados por CMPEI. El trabajo presenta una metodología de siete etapas que conforman el desarrollo e implementación de protocolos de actuación ante eventos o tendencias inusuales que se manifiesten en un comportamiento estructural atípico o degeneren la condición estructural de los puentes. La evaluación del comportamiento estructural de los puentes se realiza mediante un Sistema Inteligente de Monitoreo (SIM), programado en LabVIEW, el cual permite dar seguimiento a los eventos que provocan una respuesta diferente a las condiciones de operación normal de la estructura en coordinación con las autoridades responsables de la conservación y mantenimiento de los puentes y las autoridades responsables de la seguridad de los usuarios. La aplicación de la metodología de estudio se realizó en el puente Río Papaloapan obteniendo como resultado la implementación de los protocolos de actuación en tiempo real, a través de la definición de los límites para la activación de las alarmas y la administración automática de los datos del monitoreo y el seguimiento de las alarmas. El SIM es la primera y única plataforma desarrollada e implementada en nuestro país dedicada a la gestión automática de los datos en el monitoreo remoto de estructuras.