La Región Península de Yucatán y Caribe Mexicano está conformada por 25 Áreas Naturales Protegidas reconocidas a nivel mundial por su alto valor ambiental, las cuales suman 8,562,758.47 hectáreas. 

Reservas de la Biosfera
Reserva de la Biosfera Arrecifes de Sian Kaan
Reserva de la Biosfera Banco Chinchorro 
Reserva de la Biosfera Calakmul 
Reserva de la Biosfera Caribe Mexicano
Reserva de la Biosfera Los Petenes
Reserva de la Biosfera Ría Calestún 
Reserva de la Biosfera Ría Lagartos
Reserva de la Biosfera Sian Kaan
Reserva de la Biosfera Tiburón Ballena

Parques Nacionales
Parque Nacional Tulum 
Parque Nacional Arrecife Alacranes
Parque Nacional Arrecifes de Cozumel
Parque Nacional Arrecifes de Xcalak 
Parque Nacional Dzibilchantún 
Parque Nacional Isla Contoy
Parque Nacional Arrecife de Puerto Morelos 
Parque Nacional Costa Occidental de Isla Mujeres, Punta Cancún y Punta Nizuc

Áreas de Protección de Flora y Fauna
Área de Protección de Flora y Fauna Yum Balam 
Área de Protección de Flora Uaymil 
Área de Protección de Flora y Fauna Manglares de Nichupté
Área de Protección de Flora y Fauna Otoch Maax Yetel Kooh
Área de Protección de Flora y Fauna Balaan Kaax
Área de Protección de Flora y Fauna Isla de Cozumel
 

Santuarios 
Santuario Playa de Isla Contoy 
Santuario Playa adyacente a la localidad denominada Río Lagartos