La Dirección Regional egión Occidente y Pacífico Centro está conformada por 29 Áreas Naturales Protegidas reconocidas a nivel mundial por su alto valor ambiental.
Reservas de la Biosfera
Reserva de la Biosfera Chamela - Cuixmala
Reserva de la Biosfera Islas Marías
Reserva de la Biosfera Sierra de Manantlán
Reserva de la Biosfera Marismas Nacionales Nayarit
Reserva de la Biosfera Zicuirán - Infiernillo
Parques Nacionales
Parque Nacional Islas Marietas
Parque Nacional Barranca del Cupatitzio
Parque Nacional Cerro de Garnica
Parque Nacional Insurgentes José María Morelos
Parque Nacional Isla Isabel
Parque Nacional Lago de Camécuaro
Parque Nacional Volcán Nevado de Colima
Parque Nacional Rayón
Áreas de Protección de Flora y Fauna
Área de Protección de Flora y Fauna El Jabalí
Área de Protección de Flora y Fauna Sierra de Quila
Área de Protección de Flora y Fauna La Primavera
Área de Protección de Flora y Fauna Pico de Tancítaro
Áreas de Protección de Recursos Naturales
Área de Protección de Recursos Naturales CADNR 001 Pabellón
Área de Protección de Recursos Naturales CADNR 043 Estado de Nayarit
Área de Protección de Recursos Naturalas Las Huertas
Santuarios
Santuario Islas La Pajarera, Cocinas, Mamut, Colorada, San Pedro, San Agustín, San Andrés y Negrita, y los Islotes Los Anegados, Novillas, Mosca y Submarino
Santuario Playa Cuitzmala
Santuario Playa Maruata
Santuario Playa Colola
Santuario Playa de Mismaloya
Santuario Playa El Tecuán
Santuario Playa Mexiquillo
Santuario Playa Piedra de Tlacoyunque
Santuario Playa Teopa