La finalidad de las reservas de agua para el medio ambiente es lograr la conservación del medio ambiente y los ecosistemas de una cuenca, dando sustento a todas las actividades que en ella se desarrollen fortaleciendo la gestión integrada de los recursos hídricos.
El Programa Nacional de Reservas de Agua (PNRA) para el medio ambiente, busca entre varios objetivos:
I) Establecer un sistema nacional de reservas de agua para el medio ambiente;
II) Demostrar sus beneficios como instrumento garante de la funcionalidad del ciclo hidrológico y sus servicios ambientales; y
III) Fortalecer la aplicación de la norma mexicana de caudal ecológico en el país.
Se considera que algunos de los beneficios de esta reservas de agua, son:
I) Conectividad hidrológica en las cuencas y humedales
II) Conservación de los humedales y las actividades presentes en ellas
III) Mejores condiciones de resiliencia (adaptación al cambio climático). Captura de carbono en humedales
IV) Garantía legal de agua (decreto)
V) Creación de capacidades y cultura del agua en términos de su conservación y protección