Cecilia Ayón Cárdenas nació el 21 de enero de 1964. Estudió la Licenciatura en Actuaría y el Diplomado en Finanzas Corporativas en el Instituto Tecnológico Autónomo de México (ITAM). Realizó también el Programa de Estudios Avanzados en Desarrollo Sustentable y Medio Ambiente (LEAD-MÉXICO) de El Colegio de México.

De 1996 al 2000 trabajó en la Secretaría de Medio Ambiente, Recursos Naturales y Pesca primero en la Unidad Coordinadora de Estudios Económicos y posteriormente en la Coordinación de Asesores de la Subsecretaría de Planeación, a cargo del Programa de Mejora Regulatoria y el Sistema de Calidad.  Antes de esto se desarrolló en finanzas corporativas en el mercado financiero. 

A partir de abril del 2001 forma parte de la Coordinación Nacional de la Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad.